Le 1997 réserve à Mancini un nouveau cycle : il croit au projet du président Sergio Cragnotti et va à la Lazio. Il a beaucoup de satisfactions à Rome: il prend son deuxième scudetto dans la saison 1999/2000, sa deuxième Coppa delle Coppe (1999) et une Supercoppa Uefa (1999).
Il gagne deux Coppa Italia (1997 et 1998) et une Supercoppa di Lega. Il était déjà entraineur mais à mars du 2000, même s’il continue à jouer, il devient officiellement le vice de Sven Goran Eriksonn.
Avec les « bianco-celesti » il fait 24 buts en 112 présences (87 en Série A, 2 en Coppa Italia, 9 en Champions League, 6 en Coppa Uefa) avant de déménager en 2001, pour peu de temps, en Angleterre au Leicester City.