В 1997 году для Манчини начинается новый этап. Он поддерживает проект Президента Серджио Краньотти и переходит в клуб Лацио. В Риме Роберто вновь завоевывает такие трофеи как: второй «скудетто» в сезон 1999/2000, второй Кубок Кубков (1999) и Суперкубок УЭФА (1999). А также выигрывает 2 Кубка Италии (в 1997 и 98 гг.) и Supercoppa di Lega. Продолжая играть за команду, уже делает первые шаги на поприще тренера, в качестве официального ассистента Звена Горана Эрикссона в 2000 году.
В составе команды «белоголубых» забивает 24 гола и участвует в 112 матчах (87 из которых в Серии А, 2 в Кубке Италии, 9 в Лиге Чемпионов и 6 в Кубке УЭФА). Все это до своего недолгого переезда в Англию для участия в команде Лейчестер Сити в январе 2001 года.
